会の趣旨

Bio"Pack"athon（バイオパッカソン）は、生命科学分野で利用されるデータベースや、 データ解析手法を、各種プログラミング言語のパッケージとして実装し、 オープンソースとして公開することを目的としたハッカソンです。

ハッカソンで行うことには、RのパッケージをBioconductorで公開することを「主に」想定しています。 (ただしRでなくPython、Julia、Rustといった言語のパッケージ[PyPI、conda-forge、crate]でもOKです!)

さしあたっての目標は 「Bioconductorのpackage authorを増やし、2021年のBioC Asiaを日本で開催すること」 です。

「BioconductorとBioconductorについて」は このスライド もご覧ください。

Bio"Pack"athonは毎月第2水曜の夕方5時からZoomを用いて行っています。 ZoomのURLはconnpassの「参加者への情報」機能により本イベントページに表示されるようになっています。 (「参加者への情報」は参加登録者と発表者のみに公開されます)

Bio"Pack"athonはBioconductorからBioconductorのコミュニティイベントの一つとして認識されています。 (Bioconductorの公式イベントカレンダーを参照するには こちら をクリックしてください)

これまでの活動の記録は https://sites.google.com/view/biopackathon/ をご覧ください。

スケジュール

17:00 ~ 17:10, Bio"Pack"athonの紹介 @kozo2

17:10 ~ 17:25 Bioconductor(というかほぼR)パッケージの作り方 @kozo2

17:25 ~ 17:35 Bioconductorに関する雑多なことの紹介 @kozo2

17:40 ~ 19:40 パッケージ開発 (開発計画の共有、それに関する質問など)

19:40 ~ 20:00 まとめ