【オンライン】「ゼロから実践する 遺伝統計学セミナー〜疾患とゲノムを結びつける」を読む・手を動かす①

京都をベースにする「はんなりPythonの会」は

1. オープンでフラットなプログラミングコミュニティ
2. 初心者からエキスパートまで集まれる
3. 交流のハブになる
4. 交流する

ことを主な目的に普段活動しています。 会として初の読書会を定例会とは別にオンライン開催いたします。 京都以外の地域からの参加も大歓迎いたします。

はんなりPython

ブログ: https://hannaripython.hatenadiary.com/
Gitter: https://gitter.im/hannari-python/Lobby
Scrapbox: https://scrapbox.io/hannari-python/

概要

今回読む本

「ゼロから実践する　遺伝統計学セミナー　疾患とゲノムを結びつける」（岡田随象／著：羊土社） https://www.yodosha.co.jp/yodobook/book/9784758120920/index.html

• なお、本の選択にあたっては本会が自発的に行ったものであり、出版社・著者とは一切の関係がないことをお断りしておきます。

開催形式

• 場所： 各自の好きな場所！
• 隔週の土曜日午後,２時間
• 1章/回　(全10章)
• 発表者による章の要約とハンズオン

オンライン開催します。 Google Meetを使います。URLは事前に参加者にのみ Connpassのメール でお伝えします。

対象

本書の「はじめに」で著者は次のように記しています。

『遺伝統計学・夏の学校＠大阪大学』を開催しています．夏休みの3日間を使って，遺伝統計学の座学から，Linuxコマンドの使い方，プログラミングや統計解析ソフト入門，実際のゲノムデータを使った演習まで一通り実施する，短期実践セミナーになります．『ゲノムデータ解析って思ったより簡単なんだ』と感じてもらうことを目的に開始したこのセミナーです. (中略) 本書は，「遺伝統計学・夏の学校＠大阪大学」における実際の演習内容に沿った形で構成されています．遺伝学やバイオインフォマティクスを習ったことのない初心者を対象に，入門書としての位置づけを目指しています．本書を通じて基礎を固めた後は，より詳しい専門書やインターネットを通じて，最新の知識を習得していただければと思います．この本が，遺伝統計学の世界を覗いてみたいと考えている皆さんの，最初の一歩になれば幸いです.

これを読んで、

-コマンドライン操作、プログラミング、統計解析、遺伝学やバイオインフォマティクスのうちの何れか/全てに馴染みのない人 -何れかが得意で応用の幅を広げたい人

が「最初の一歩に」したいと感じたなら、対象者です。

今回の内容

本書目次 https://www.yodosha.co.jp/bookdata/9784758120920/9784758120920_contents.pdf のうち、

1. (発表枠１) 第1章の要約
2. (発表枠2 )第4・５・６章のうちのコマンドライン操作の為の環境設定に相当するところ

を行います。 このうち２については、各回の予習の段階で環境設定を各自で行う負担を軽減するために第１回目で取り上げることにしました。なお、こちらで資料を用意します。 第4章のCygWinは、Windows PCでLinux環境を使えるようにする設定方法としてを使っています。本読書会ではWindows10の機能として提供されているWindows Subsystem for Linux(WSL)の有効化とMicrosoftStoreで無料配布されているLinuxディストリビューションをインストールして使う予定です。

事前準備

書籍は各自で購入してください。

周辺ノイズ・ハウリング防止の目的上、 ヘッドセットかイヤホンマイクあるいは「PCマイク＋イヤホン」をご用意ください。 「PCマイク＋内蔵スピーカー」は不可（内蔵スピーカーの音を拾うので大変聴きづらくなります）。 アイスプレイク（自己紹介）と発言時にはできれば顔出ししていただければと思いますが、Google Meetは背景をぼがす設定しかありませんのでご注意ください。 お子さんがいる自宅からの参加も想定されますが、お子さんの映り込み、大歓迎です。なごみます。

• PC : Mac, Windows10, Linux 何れかのOSで動くPCを御用意ください。また内蔵ディスクの空き容量は十分に確保しておいて下さい。
• 通信環境 : 光回線に接続したLANかWi-Fi (スマホでのテザリング・mobile Wi-Fiルーター不可 )

参加枠での申し込みについて

ご自身のPCスペックとOSをコメントして下さい( CPU,メモリ,OS )。 参加用URLの送信後、直前で申し込まれた場合はScrapbox: https://scrapbox.io/hannari-python/ に問い合わせて下さい。